不死の新人類＝「亜人」をめぐる争いを描く桜井画門のコミックを映画化した劇場用アニメーション3部作の第2部亜人研究所から脱走を図った主人公・永井圭の行動や、帽子の男こと佐藤の真意、追い詰められた亜人管理委員会の責任者・戸崎の思惑などが絡み合い、亜人と日本国政府の攻防が社会全体を巻き込んでいく様を描く。テロリスト・佐藤の呼びかけに応じて7人の亜人が集結し、佐藤は彼らに驚くべき計画を告げる。集められた亜人のひとり、中野攻は、佐藤の話に戸惑いを隠せずにいたが……。新キャストとして鈴村健一、森川智之、坂本真綾、梶裕貴らが参加。